Meine Theorie:
Ob ein Pony überhaupt ein Alicorn werden kann, ist genetisch festgelegt, dieses Gen ist aber untrennbar an die Geschlechterfestlegung gekoppelt und kann nur bei weiblichen Ponys aktiviert werden (vgl. Menschen-DNA: Chromosomenpaar 23, die Geschlechtschromosomen, müssen XX sein; ist es XY, hat sich der Fall erledigt). Könnte daran liegen, daß je die Hälfte der Veranlagung auf einem X-Ast der beiden Chromosomen liegt, bei Y fehlt der zweite Ast natürlich: Veranlagung unvollständig und damit nicht aktivierbar, deshalb gibts keine männlichen Alicorns. Aber auch nicht jedes weibliche Pony hat die vollständigen Anlagen, deshalb wird die Kombination XX + beide Alicorn-DNA-Hälften komplett vereint schon sehr selten.
Über die Jahrhunderte müßte es nun trotzdem etliche Alicorns gegeben haben, hat es aber anscheinend nicht. Also muß die Veranlagung erst aktiviert werden... und das wiederum geschieht sicher durch Magie (man könnte es auch "Hormonpräparate" nennen), die das herrschende Alicorn seinem Nachfolger verabreicht. Welche Ponys dafür überhaupt nur in Frage kommen (d.h. die vollständigen genetischen Anlagen haben), zeigt wiederum Magie (= ein DNA-Screening, klingt aber so "unmagisch"). Solange, bis die Aktivierung erfolgt, lebt das Pony ganz normal als das, was es normalerweise wäre, und altert auch dementsprechend. - Da man als Alicorn aber Magie braucht, liegt es nahe, daß zur Aktivierung nur Unicorns in Betracht gezogen werden.
Sehen wir uns die aktuellen Ponys an: Celestia, wiewohl deutlich über 1000 Jahre alt, scheint noch immer in ihrem ersten Lebensdrittel zu sein, die Lebenserwartung eines Alicorns liegt nach der Aktivierung offenbar im Bereich von mindestens 3000, eher noch mehr Jahren (falls nicht nach einer langen unveränderlichen Zeitspanne auf einmal ein rasender Verfall einsetzt, darüber wissen wir leider nichts). Trotzdem weiß sie, daß sie nicht ewig leben wird, und hat nun, nach 1000 Jahren, endlich mal die Augen aufgemacht auf der Suche nach einer Nachfolgerin für sich (die Herrscherin des Tages; Luna müßte vermutlich dasselbe mal für sich in Angriff nehmen, sie ist aber jünger und wird wohl erst in 100 oder 200 Jahren mal anfangen, sich darüber Gedanken zu machen). Diese Nachfolgerin hat sie gefunden: Twilight Sparkle. Diese besticht durch schon recht starke Magie (schon erstmal gute Zugangsvoraussetzung für den Job), hat aber nur schwache soziale Kompetenzen und wird deshalb nach Ponyville geschickt, um sich diese zu erwerben (für eine freundliche Herrscherin sicher unabdingbar, sonst würde sie eine welt- und ponyfremde Bürokratin oder Technokratin als zukünftige Herrscherin abgeben). In einigen Jahren, wenn Twilight mit ihren Studien weit genug fortgeschritten ist, bekommt sie dann von Celestia das Hormonpräparat - äh - die Magie, und ihre Alicorn-Gene werden aktiviert. Folge: ihr wachsen Flügel, ihr Horn wächst, und ihr Körperbau wird größer. Wie lange dieser Prozeß dauern wird, ist wieder unbekannt, kann aber gut und gerne 100 Jahre dauern: von nun an wird sie genauso langsam altern wie die drei bisher bekannten Alicorns auch. Und irgendwann überträgt Celestia dann ihre Macht an sie, und der Zyklus beginnt von Neuem (d.h. irgendwann wird die dann über 1000jährige Twilight Sparkle ihre Nachfolgerin suchen, finden und an ihr "Handwerk" heranführen, so wie es mit ihr selbst einst geschehen ist).
Das erste aktive Alicorn überhaupt kann eine zufällige Variante gewesen sein... muß ja reinerbig gewesen sein; das Hormonpräparat zum Aktivieren kann zufällig durch irgendein Naturereignis oder als Nebenprodukt eines alchimistischen / magischen Experimentes entstanden sein. Das so aktivierte Alicorn hatte nach seiner "Erstaktivierung" ja dann genug Zeit, herauszufinden, was passiert war und warum es auf einmal anfing, sich von den übrigen Ponys so deutlich zu unterscheiden.
Soweit "my little evolutionary theory"
